Prof. Gerard JP van Westen

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Coautores

Herman van VlijmenHead, Computational ChemistryDirección de correo verificada de its.jnj.com
Andreas BenderUniversity of Cambridge; Pangea Bio; Universitatea Babeș-Bolyai; UMF ClujDirección de correo verificada de cam.ac.uk
Laura HeitmanFull Professor of Molecular PharmacologyDirección de correo verificada de lacdr.leidenuniv.nl
Willem JespersLeiden UniversityDirección de correo verificada de lacdr.leidenuniv.nl
Eelke Bart LenselinkGalapagosDirección de correo verificada de glpg.com
Jörg Kurt WegnerDirector, In Silico Discovery, Janssen R&D, Cambridge, MA, USDirección de correo verificada de its.jnj.com
Lindsey BurggraaffLeiden UniversityDirección de correo verificada de lacdr.leidenuniv.nl
Isidro Cortés CirianoEMBL-EBIDirección de correo verificada de ebi.ac.uk
Brandon J BongersLeiden UniversityDirección de correo verificada de lacdr.leidenuniv.nl
Therese MalliavinLaboratoire de Physique et Chimie ThéoriquesDirección de correo verificada de univ-lorraine.fr
George PapadatosHead of Data, Syngenta CP R&DDirección de correo verificada de syngenta.com
Julio Saez RodriguezHeidelberg UniversityDirección de correo verificada de uni-heidelberg.de
Bob van de WaterProfessor of Drug Safety Sciences, Leiden UniversityDirección de correo verificada de lacdr.leidenuniv.nl
Olivier BéquignonAmsterdam UMCDirección de correo verificada de lacdr.leidenuniv.nl
Marina Gorostiola GonzálezPhD candidate, Leiden UniversityDirección de correo verificada de lacdr.leidenuniv.nl
Mario van der SteltLeiden UniversityDirección de correo verificada de chem.leidenuniv.nl
Mukesh BansalBristol Myers SquibbDirección de correo verificada de bms.com
James CostelloUniversity of Colorado Anschutz Medical CampusDirección de correo verificada de ucdenver.edu
Michael P. MendenAssociate Professor, University of Melbourne, Department of Biochemistry and PharmacologyDirección de correo verificada de helmholtz-muenchen.de
Pim Gal MD PhDCentre for Human Drug ResearchDirección de correo verificada de chdr.nl

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Prof. Gerard JP van Westen

PI Computational Drug Discovery (Professor AI & Med Chem, Leiden University)

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Título Ordenar por citas Ordenar por año Ordenar por título	Citado por Citado por	Año
A community effort to assess and improve drug sensitivity prediction algorithms JC Costello, LM Heiser, E Georgii, M Gönen, MP Menden, NJ Wang, ... Nature biotechnology 32 (12), 1202-1212, 2014	798	2014
Random Forest ensembles for detection and prediction of Alzheimer's disease with a good between-cohort robustness AV Lebedev, E Westman, GJP Van Westen, MG Kramberger, ... NeuroImage: Clinical 6, 115-125, 2014	340	2014
Beyond the hype: deep neural networks outperform established methods using a ChEMBL bioactivity benchmark set EB Lenselink, N Dijke, B Bongers, G Papadatos, HWT Vlijmen, ... Journal of cheminformatics 9 (1), 45, 2017	337	2017
A community computational challenge to predict the activity of pairs of compounds M Bansal, J Yang, C Karan, MP Menden, JC Costello, H Tang, G Xiao, ... Nature biotechnology 32 (12), 1213-1222, 2014	334	2014
Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen Nature Communications 10, 2674, 2019	314	2019
Importance of the extracellular loops in G protein-coupled receptors for ligand recognition and receptor activation MC Peeters, GJP Van Westen, Q Li, AP IJzerman Trends in pharmacological sciences 32 (1), 35-42, 2011	270	2011
Proteochemometric modeling as a tool to design selective compounds and for extrapolating to novel targets GJP Van Westen, JK Wegner, AP IJzerman, HWT Van Vlijmen, A Bender MedChemComm 2 (1), 16-30, 2011	208	2011
Advances in GPCR modeling evaluated by the GPCR Dock 2013 assessment: meeting new challenges I Kufareva, V Katritch, RC Stevens, R Abagyan Structure 22 (8), 1120-1139, 2014	188	2014
Novel technologies for metabolomics: More for less P Miggiels, B Wouters, GJP van Westen, AC Dubbelman, T Hankemeier TrAC Trends in Analytical Chemistry 120, 115323, 2019	153	2019
Optogenetic activation of intracellular adenosine A2A receptor signaling in the hippocampus is sufficient to trigger CREB phosphorylation and impair memory P Li, D Rial, PM Canas, JH Yoo, W Li, X Zhou, Y Wang, GJP van Westen, ... Molecular psychiatry 20 (11), 1339-1349, 2015	152	2015
Structure-based identification of OATP1B1/3 inhibitors T De Bruyn, GJP Van Westen, AP IJzerman, B Stieger, P de Witte, ... Molecular pharmacology 83 (6), 1257-1267, 2013	143	2013
Polypharmacology modelling using proteochemometrics (PCM): recent methodological developments, applications to target families, and future prospects I Cortés-Ciriano, QU Ain, V Subramanian, EB Lenselink, O Méndez-Lucio, ... MedChemComm 6 (1), 24-50, 2015	139	2015
Benchmarking of protein descriptor sets in proteochemometric modeling (part 1): comparative study of 13 amino acid descriptor sets GJP van Westen, RF Swier, JK Wegner, AP IJzerman, HWT van Vlijmen, ... Journal of Cheminformatics 5 (1), 41, 2013	137	2013
Improved large-scale prediction of growth inhibition patterns using the NCI60 cancer cell line panel I Cortes-Ciriano, GJP Van Westen, G Bouvier, M Nilges, JP Overington, ... Bioinformatics 32 (1), 85-95, 2016	132	2016
Advances and challenges in computational target prediction D Sydow, L Burggraaff, A Szengel, HWT van Vlijmen, AP IJzerman, ... Journal of Chemical Information and Modeling 59 (5), 1728-1742, 2019	124	2019
Artificial intelligence for natural product drug discovery MW Mullowney, KR Duncan, SS Elsayed, N Garg, JJJ van der Hooft, ... Nature Reviews Drug Discovery 22 (11), 895-916, 2023	119	2023
Benchmarking of protein descriptor sets in proteochemometric modeling (part 2): modeling performance of 13 amino acid descriptor sets GJP van Westen, RF Swier, I Cortes-Ciriano, JK Wegner, JP Overington, ... Journal of cheminformatics 5, 1-20, 2013	102	2013
Chemical, target, and bioactive properties of allosteric modulation GJP van Westen, A Gaulton, JP Overington PLoS Computational Biology 10 (4), e1003559, 2014	94	2014
The RESOLUTE consortium: unlocking SLC transporters for drug discovery G Superti-Furga, D Lackner, T Wiedmer, A Ingles-Prieto, B Barbosa, ... Nature reviews Drug discovery 19 (7), 429-430, 2020	92	2020
Reduced hepatitis B and D viral entry using clinically applied drugs as novel inhibitors of the bile acid transporter NTCP JM Donkers, B Zehnder, GJP van Westen, MJ Kwakkenbos, AP IJzerman, ... Scientific reports 7 (1), 15307, 2017	90	2017

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